Esta Organización es un grupo de criminales clasificados en rango S. Muchos de estos ninjas huyeron de sus aldeas después de causar muerte y destrucción. Con la salida de Orochimaru y su futura muerte, asi como la de Sasori, Kakuzu y el gran Deidara junto con la neutralización de Hidan, hay 6 miembros activos Akatsuki. El grupo sustituyó a Sasori para aceptar a Tobi, quién está deseoso de hacer su parte. La mayoría de los miembros usan su protector de la frente de su antigua aldea sin embargo este protector tiene rasgado el signo de la aldea como significado de exiliación, todos utilizan un anillo de su posición en la organización y una manta negra con nubes rojas.
Su objetivo final es controlar el mundo, lo que se logrará con tres pasos. Paso uno, es necesario para el grupo lograr conseguir dinero. Segundo paso es crear el primer grupo de mercenarios Shinobis en cada aldea para que estos consigan hacer dinero en sus países, este dinero se lo consigue mediante guerras. Dado que no ha habido guerras en gran escala alrededor de la última década, las aldeas ninja se están reduciendo de tamaño. Los Cinco Grandes Pueblos Shinobis podrían manejar esto, pero los pueblos más pequeños no podían. Akatsuki formará su propia fuerza de combate y dispondrá sus servicios a quienes puedan pagarlos, asi sea al bando contrario del que esten en un primer lugar. Con esta fuerza se debilitan todos los otros pueblos, entonces Akatsuki cobra por esto. Luego y utilizando al bijuu pueden crear nuevas batallas y nuevas guerras y obtener un monopolio sobre el mercado en su conjunto.

ANILLO Y MANICURA:

Cada miembro de Akatsuki lleva un anillo, cada uno de ellos en un dedo distinto. Esto determina la posición que adoptan durante el sellado de los Bijū, aunque se desconoce si tiene algún otro significado. En total hay diez anillos, pero tras la marcha de Orochimaru, que conservó el suyo al desertar, sólo nueve son operativos. Todavía está en su dedo meñique izquierdo.

El anillo parece ser más que una simple joya, no sólo un símbolo. La historia parece indicar que si se pierde un anillo cuando un miembro muere o se marcha, no se le puede sustituir: nadie ha ocupado el puesto de Orochimaru dado que se marchó con el anillo. Por otro lado, a la muerte de Sasori, Tobi recoge su anillo, creyendo que por ello ya tiene derecho a entrar en la organización en sustitución del marionetista. Efectivamente, luego ingresa en Akatsuki. Deidara muestra mucho interés por recuperar su brazo derecho tras la pelea con Kakashi, entre otras cosas porque en él lleva su anillo.

El miembro Akatsuki también tiene tanto las uñas de los dedos de sus manos asi como de sus pies pintadas de un tono púrpura.

BANDA NINJA:

Cada miembro lleva su tradicional protector de la frente de la aldea oculta de la cuál huyeron. Al protector se le rasga, demostrando que ya no tienen sus antiguos ideales que tenían en tiempo pasado.

MANTO AKATSUKI:

Cada miembro lleva un manto negro con nubes rojas. El interior de la capa es de color rojo. El manto es hasta la rodilla y tiene un cuello alto. Bajo el manto del ninja se ve que el miembro Akatsuki lleva el traje carácteristico de su antiguo pueblo.

Los miembros utilizan un sombrero de paja cónico con tiras de tela cubriéndoles su rostro y dos cascabeles mientras viajan.Los sombreros pueden ser utilizados para moverse entre una multitud sin ser notados.El sombrero se lo quitan cuando el personaje entra en batalla.

Un equipo formado por los dos artistas de Akatsuki, Sasori y Deidara, fueron un buen equipo en muchas ocasiones, a pesar de discutir continuamente acerca del concepto del arte. Sasori pensó que todo buen arte debía ser permanente (como sus marionetas), mientras que Deidara tenía una idea de que el mejor arte era efímero (como su arcilla explosiva). Con todo, eran un dúo muy compenetrado entre sí. Sasori tenía muchos contactos y logró establecer a un espía en la Aldea Oculta de la Arena varios años antes de que este equipo llegara para bajar las defensas de la aldea y lograr invadirla. El equipo tuvo varios argumentos y discusiones en planes; Sasori era impaciente y quería acabar las misiones lo más rápido posible, aunque esto se compensa cuando Deidara ejecuta esos planes efectivamente; como lo que hizo en su batalla contra Gaara

Un equipo formado tras la muerte de Sasori. Obito mejor conocido como Tobi porque ocultaba su identidad con su mascara, fue presentado como un reemplazó fácilmente encontrado. A pesar del entusiasmo de Obito para complacer a su "senpai", su actitud infantil fue vista como una molestia a las expectativas de Deidara de la organización por lo tanto tienen en ocasiones ciertas discusiones chistosas que hacen enfadar a Deidara. Aparte de eso, los dos trabajaban bien juntos, con Obito plantando la arcilla explosiva bajo tierra durante las peleas, aunque más adelante se descubrió que Obito nunca tuvo ningún interés en ayudar a Deidara a vencer a Sasuke. Cuando Deidara estaba a punto de autodestruirse para matar a Sasuke Uchiha, se disculpó con Obito, diciendo que él también podría recibir el radio de la explosión

Un equipo muy efectivo, aunque demasiado revoltoso, estaban normalmente haciendo trabajos que no tenían nada que ver con Akatsuki y siempre llegando tarde a las misiones y reuniones de Akatsuki. Pain decidió poner a estos dos juntos por sus habilidades únicas. Hidan, como resultado de "un experimento de la secta de Jashin", no puede ser asesinado aunque le decapiten y Kakuzu puede entrar en un estado de ira y puede matar a quién se le cruce en el camino, incluyendo su compañero. Por lo tanto, con Hidan, Kakuzu puede enfurecerse y no tendría que preocuparse por buscar un nuevo compañero más tarde.

Era un dúo que trabajaba bien, entre los dos integrantes y era efectivo; esto se debe a sus buenas relaciones y el hecho de que se complementan como opuestos; es decir, Itachi es un experto en jutsus de Fuego y Kisame Hoshigaki en Técnicas de Agua, Itachi es muy rápido y talentoso en Genjutsu, Kisame Hoshigaki en fuerza bruta; en esencia son opuestos. Al serlo son, al parecer, casi invencibles. En lo que concierne a las misiones, este equipo cumplía casi todas las misiones encargadas por Pain sin ninguna dificultad, siendo la captura del Kyūbi la única excepción, debido a la aparición de Jiraya. Itachi y Kisame  se llevaban bien el uno con el otro, casi sin conflictos entre ellos; Kisame hacía todo lo que Itachi le pedía sin dudar, y hablaban amistosamente cuando no entraban en combate. Este equipo se separó después de que Itachi muriera a manos de Sasuke Uchiha. En la batalla contra Killer Bee, Kisame es traicionado por su espada Samaheda (lo traiciona por que le gustó mucho el chakra que absorbió del Hachibi) y es decapitado por el Raikage y Killer Bee pero luego se descubre que todo es un plan de Tobi. Kisame fingió su muerte para poder intentar capturar a Naruto por su propia cuenta al intercambiar posiciones con un clon de Zetsu y luego camuflarse dentro de Samehada para así pasar desapercibido, pero luego de que Naruto terminara su entrenamiento, éste lo descubre gracias a sus nuevas habilidades. Maito Gai se enfrenta con Kisame pero en la pelea, éste pierde y sabiendo que las intenciones de los ninjas de Konoha es averiguar todo lo que él sabe sobre Tobi (el supuesto Madara) y Akatsuki, invoca unos tiburones dentro de una prisión de agua que él mismo creó para que estos lo asesinaran.

Un equipo que se lleva muy bien el uno con el otro integrante. Esto se nota porque Konan es el único miembro que dice el nombre de Pain. Como el líder de Akatsuki, Pain dirige el resto de la organización a sus metas respectivas, su interacción más directa con la organización es usar laTécnica de sellado: Sello Completo de Nueve Dragones Ilusorios. Pain es el líder de la Aldea Oculta de la Lluvia, y ostenta un título de dios de parte de los aldeanos. Konan tiene el título del "Ángel de Dios" ya que hace trabajos de parte de Pain, y se podría considerar la co-líder de dicha aldea. Tras la muerte de Pain y el abandono de Akatsuki por parte de Konan el equipo se disolvió. Ahora, se asume que Konan es la líder de la aldea de la lluvia, pues ofreció a Naruto Uzumaki todo el apoyo de esta.

Aldea Oculta: Konoha (Hoja)
Anillo: Shu (Escarlata)
Posición del Dedo: Dedo Derecho.

Información: Itachi era el hermano mayor de Sasuke Uchiha. Fue infiltrado en la organización ANBU de Konoha como un doble espía. Después de masacrar al Clan Uchiha, se unió a Akatsuki donde su compañero asignado fue Kisame Hoshigaki.

Aldea Oculta: Roca
Anillo: Sei (Azul - Verde)
Posición del Dedo: Índice Derecho.

Información: Deidara era un miembro de la organización Akatsuki. Su compañero era Tobi, aunque antiguamente fue Sasori.Deidara pertenecía a la Aldea Oculta de la Roca y utilizaba cada boca que tiene en la palma de sus manos para crear arte explosiva.

Aldea Oculta: Sonido
Anillo: Sora (Cielo)
Posición del Dedo: Meñique Izquierdo.

Información: Después de ser rechazado como Cuarto Hokage, Orochimaru empezó a estudiar jutsus prohibidos. Luego huyó de Konoha y se unió a Akatsuki. Fue compañero de Sasori durante ese tiempo. Orochimaru quería tener el Sharingan de Uchiha Itachi. Se trasladó para tomar el cuerpo de Uchiha Itachi pero Itachi fue obligado a utilizar Genjutsu con Orochimaru y éste se cortó su brazo

Aldea Oculta: Cascada
Anillo: Hoku (Norte)
Posición del Dedo: Medio Izquierdo.

Información: Kakuzu es un ninja desaparecido de la Aldea de la Cascada. Él y su compañero de equipo Hidan fueron responsables de capturar al Jinchuuriki Dos-Colas. El fué un gran cazador de recompensas, que a menudo dejaba a un lado estas labores. Su cuerpo es todo cosido ya que el inserta los corazones de sus adversarios mas fuertes para aumentar su expectativa de vida.

Aldea Oculta: Sin Nombre
Anillo: San (Tres)
Posición del Dedo: Índice Izquierdo.

Información: Hidan posee una gran guadaña y admite ser el mas lento de los Akatsuki. Él proviene de algunos de los pueblos desconocidos de la serie. El y su compañero de equipo Kakuzu fueron responsables de capturar al Jinchuuriki Dos-Colas. Hidan practica un culto a una religión de un Dios del Mal llamado Jashin

Aldea Oculta: Arena
Anillo: Tama (Izquierda)
Posición del Dedo: Pulgar Izquierdo.

Información: Sasori, también conocido como Sasori de la Arena Roja, era el nieto de Chiyo y miembro de Akatsuki.Tenía como compañero a Deidara y antes a Orochimaru (hasta que éste desertó).

Aldea Oculta: Konoha (Hoja)
Anillo: Tama (Esfera)
Posición del Dedo: Pulgar Izquierdo.

Información: Tobi inicialmente fue considerado como un asociado de Zetsu. El parecía torpe y era muy amable en sus conversaciones. Después de que Sasori murió en batalla estubo deseoso de reemplazarlo como nuevo miembro Akatsuki. Finalmente tuvo éxito y al parecer se hizo cargo del puesto que dejo Sasori.

Aldea Oculta: Lluvia
Anillo: Byaku / Haku (Blanco)
Posición del Dedo: Medio Derecho.

Información: Konan era la fiel amiga y compañera de Pain. También era miembro de la organización Akatsuki siendo la única mujer. Tenía un talento natural para el origami.

Aldea Oculta: Neblina
Anillo: Minami (Sur)
Posición del Dedo: Dedo Izquierdo.

Información:Kisame Hoshigaki, conocido como el Monstruo de la neblina , era un ninja renegado de Kirigakure, ex miembro de los Siete Espadachines de la Niebla y anteriormente compañero de Itachi Uchiha en Akatsuki. 

Aldea Oculta: Hierba
Anillo: Kai (Jabalí)
Posición del Dedo: Meñique Derecho.

Información: Zetsu es un humano creado artificialmente cuya mitad está hecha del ADN de Hashirama Senju y la otra mitad está infundida con la voluntad de Madara Uchiha. Luego de ayudar a Obito Uchiha en su reunion con Nagato, Zetsu se convirtió en uno de los miembros más importantes de Akatsuki, sirviendo como mano derecha del creador de la organización. 

Aldea Oculta: Lluvia
Anillo: Rei (Cero)
Posición del Dedo: Pulgar Derecho.

Información: Nagato, mejor conocido como Pain , era uno de los más poderosos shinobi, y el líder reconocido de Akatsuki y de Amegakure. Todos los miembros de Akatsuki se referían a él como “Líder”, excepto Konan quien lo llamaba por su nombre, Pain. También era usuario del dōjutsu legendario, el Rinnegan quien fue dado por Madara Uchiha antes de su muerte e implantado en Nagato cuando sólo era un niño.

YAHIKO: fue el fundador de la organización Akatsuki y perteneció a los Huérfanos de la Lluvia, junto a Nagato y Konan, que fueron entrenados por Jiraiya poco después de la Segunda Guerra Mundial Shinobi.Luego de su muerte, Nagato utilizó el cuerpo de Yahiko para que fuera el Camino Deva de los Seis Caminos del Dolor.

DAIBUTSU: fue uno de los primeros miembros que fueron parte de la organización Akatsuki.

KYūSUKE: fue ex-shinobi de Amegakure que decidió formar parte de Akatsuki como uno de sus miembros fundadores.